細(xì)菌也對(duì)人類活動(dòng)有很大的影響。一方面，細(xì)菌是許多疾病的病原體，可以通過(guò)各種方式，如接觸、消化道、呼吸道、昆蟲叮咬等在正常人體間傳播疾病，具有較強(qiáng)的傳染性，對(duì)社會(huì)危害極大。另一方面，人類也時(shí)常利用細(xì)菌，例如乳酪及酸奶和酒釀的制作、部分抗生素的制造、廢水的處理等，都與細(xì)菌有關(guān)。在生物科技領(lǐng)域中，細(xì)菌也有著廣泛的運(yùn)用。
細(xì)菌廣泛分布于土壤和水中，或者與其他生物共生。人體身上也帶有相當(dāng)多的細(xì)菌。據(jù)估計(jì)，人體內(nèi)及表皮上的細(xì)菌細(xì)胞總數(shù)約是人體細(xì)胞總數(shù)的十倍。此外，也有部分種類分布在極端的環(huán)境中，例如溫泉，甚至是放射性廢棄物中，它們被歸類為嗜極生物，其中最著名的種類之一是海棲熱袍菌，科學(xué)家是在意大利的一座海底火山中發(fā)現(xiàn)這種細(xì)菌的。然而，細(xì)菌的種類是如此之多，科學(xué)家研究過(guò)并命名的種類只占其中的小部分。細(xì)菌域下所有門中，只有約一半是能在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的種類。